总建筑面积为103101.94平方米的商业建筑，应该选择怎样的变压器？

这个不太好回答，你只有建筑面积，不知道属于什么类型的商业建筑，是否需要配置空调和其他辅助设施？另外楼层多高？
如果仅仅估算普通商铺的照明用电，每平方10W的光照度就够了，以此推算，总照明功率1031KW，平均分配到三相电源，约等于344KW。
加上空调、冰箱、电梯等辅助设施300KW（不知道预估是否够用），总负荷644KW。
1000KVA的变压器额定电流为1443A，可以满足估算使用要求。