工程施工??合同毛利科目有余额，在账务上怎么做处理？如果何解此合同是亏还是盈，借贷方各代表什么？

首先要说明的是：“工程施工”科目在工程项目完工结算后与“工程结算”科目对冲后应为零，你所说的“合同毛利”对冲后有余额应是核算中出现了差错。
原因是：“工程结算”科目登记的是已结算的合同价款，而“主营业务收入”是按完工进度确认的合同价款，故当项目峻工结算时，这两个科目余额（发生额）应是相等的；同样道理，“主营业务成本”是按完工进度确认的，而完工进度是根据“工程施工?合同成本”来确定的，故这两个科目累计数应该是相等的，我们来看第一个分录：
确认收入时：（假设）
借：主营业务成本