员工旷工三天按公司规定予以辞退,但法院说旷工三天不算严重违反劳动纪律,不能辞退.?

法院的说法是正确的,你公司的制度违反了法律的强制性规定,法律规定是连续旷工5天以上,或者年累计旷工15天以上才属于严重违反劳动纪律,企业可以给予辞退处理.